E.Λ.Κ.Ε. του Πανεπιστημίου Πατρών παρακρατεί ποσοστό 10% επί του συνολικού προϋπολογισμού όλων των έργων που διαχειρίζεται για την κάλυψη των εξόδων λειτουργίας του, με την επιφύλαξη ειδικών όρων που ενδέχεται να περιλαμβάνονται στη σύμβαση χρηματοδότησης ή στο κανονιστικό πλαίσιο διαχείρισης του έργου καθώς και των ειδικότερων προβλέψεων που ακολουθούν για επιμέρους κατηγορίες έργων. Σε περιπτώσεις που το ποσοστό ορίζεται από το κανονιστικό πλαίσιο μικρότερο του 10%, κατά την έγκριση ανάληψης διαχείρισης έργου θα πρέπει να ορίζεται η κάλυψη της διαφοράς του ποσοστού από άλλη κατηγορία του ίδιου ή άλλου έργου.
Δεν επιβάλλεται κράτηση στα έργα που χρηματοδοτούνται από ιδίους πόρους του Ε.Λ.Κ.Ε. καθώς και στα έργα διάθεσης ταμειακών υπολοίπων ολοκληρωμένων έργων και έργα που αφορούν αμιγώς χορήγηση υποτροφιών, βραβείων και προμήθεια εξοπλισμού.
Ειδικά για τα μεταπτυχιακά προγράμματα σπουδών που λειτουργούν με τέλη φοίτησης ο Ε.Λ.Κ.Ε. παρακρατεί ποσό που αντιστοιχεί στο 30% των συνολικών εσόδων που προέρχονται από τέλη φοίτησης. Tο 10% διατίθεται για την κάλυψη των λειτουργικών εξόδων του Ε.Λ.Κ.Ε. και με εισήγηση της Επιτροπής Ερευνών τον Μάρτιο κάθε έτους, αποφασίζεται από το Συμβούλιο Διοίκησης αν το υπόλοιπο ποσό μετά την αφαίρεση της παρακράτησης υπέρ Ε.Λ.Κ.Ε. μεταφέρεται στον τακτικό προϋπολογισμό ή διατίθεται για τη δημιουργία έργων/προγραμμάτων μέσω του Ε.Λ.Κ.Ε. με σκοπό τη κάλυψη κατά προτεραιότητα των αναγκών Π.Μ.Σ. που λειτουργούν χωρίς τέλη φοίτησης και την κάλυψη ερευνητικών, εκπαιδευτικών και λειτουργικών αναγκών του
Ιδρύματος. Για τα λοιπά έσοδα του Π.Μ.Σ. πραγματοποιείται παρακράτηση 10%.
Για τα Ξενόγλωσσα Προγράμματα Σπουδών η παρακράτηση ανέρχεται σε 10% επί των συνολικών τους εσόδων.
Στα συνέδρια των οποίων την πλήρη διαχείριση (έσοδα και έξοδα), έχει η Μ.Ο.Δ.Υ. Ε.Λ.Κ.Ε., θα γίνεται κράτηση 5% επί του συνόλου των εσόδων. Κράτηση 10% θα γίνεται στο ταμειακό υπόλοιπο του συνεδρίου, εφόσον προκύψει, μετά την ολοκλήρωσή του.
Επίσης σε ειδικές περιπτώσεις, μετά από έγκριση της Επιτροπής Ερευνών και τη σύμφωνη γνώμη του Επιστημονικά Υπευθύνου, δύναται να παρακρατείται ποσοστό μεγαλύτερο του 10% και όχι ανώτερο του 25% το οποίο θα διατίθεται ως διακριτό Φ.Κ. για την κάλυψη ερευνητικών και εκπαιδευτικών αναγκών σύμφωνα με πρόταση του Επιστημονικά Υπευθύνου. Οι παραπάνω εγκρίσεις θα κοινοποιούνται στο Συμβούλιο Διοίκησης.
Για τα προγράμματα του Κ.Ε.Δ.Ι.Β.Ι.Μ., η παρακράτηση ανέρχεται σε 30% επί των συνολικών εσόδων τους, η οποία κατανέμεται ως εξής: το 20% για το Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. και 10% για τη κάλυψη των λειτουργικών αναγκών του Ε.Λ.Κ.Ε.
Η παρακράτηση του Ε.Λ.Κ.Ε. σε χορηγίες και δωρεές που λαμβάνει το Ίδρυμα για τις δραστηριότητες των φοιτητικών και εθελοντικών ομάδων είναι μηδέν, θέλοντας να στηριχθεί το έργο των ομάδων και να προωθηθούν οι δράσεις τους με αποτελεσματικό τρόπο.
Η παρακράτηση του Ε.Λ.Κ.Ε. για τα Ξενόγλωσσα Προπτυχιακά Προγράμματα Σπουδών με τέλη φοίτησης, ανέρχεται σε ποσοστό 17% επί των συνολικών εσόδων των προγραμμάτων αυτών (10% υπέρ Ε.Λ.Κ.Ε. και 7% υπέρ Ιδρύματος με πίστωση σε διακριτό φορέα κόστους).